Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRTO14522 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRTO14522 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRTO14522 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRTO14522 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRTO14522 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRTO14522 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRTO14522 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRTO14522 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRTO14522 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRTO14522 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRTO14522 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRTO14522 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRTO14522 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRTO14522 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRTO14522 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRTO14522 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRTO14522 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRTO14522 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRTO14522 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRTO14522 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRTO14522 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRTO14522 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRTO14522 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRTO14522 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PTPRTO14522 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PTPRTO14522 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PTPRTO14522 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PTPRTO14522 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPRTO14522 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPRTO14522 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPRTO14522 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPRTO14522 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPRTO14522 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPRTO14522 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPRTO14522 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPRTO14522 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPRTO14522 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPRTO14522 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRTO14522 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRTO14522 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRTO14522 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRTO14522 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRTO14522 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRTO14522 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRTO14522 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRTO14522 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRTO14522 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRTO14522 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRTO14522 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRTO14522 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRTO14522 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRTO14522 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRTO14522 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRTO14522 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRTO14522 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRTO14522 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRTO14522 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRTO14522 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRTO14522 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRTO14522 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRTO14522 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRTO14522 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRTO14522 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRTO14522 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRTO14522 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRTO14522 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRTO14522 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRTO14522 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRTO14522 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRTO14522 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRTO14522 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRTO14522 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRTO14522 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRTO14522 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPRTO14522 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPRTO14522 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPRTO14522 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPRTO14522 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPRTO14522 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPRTO14522 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPRTO14522 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPRTO14522 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPRTO14522 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPRTO14522 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPRTO14522 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPRTO14522 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPRTO14522 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPRTO14522 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPRTO14522 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPRTO14522 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPRTO14522 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPRTO14522 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPRTO14522 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPRTO14522 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPRTO14522 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPRTO14522 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPRTO14522 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRTO14522 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRTO14522 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
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