Protein–RNA interactions for Protein: O00472

ELL2, RNA polymerase II elongation factor ELL2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL2O00472 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ELL2O00472 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ELL2O00472 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ELL2O00472 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ELL2O00472 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ELL2O00472 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ELL2O00472 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ELL2O00472 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ELL2O00472 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ELL2O00472 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ELL2O00472 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ELL2O00472 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ELL2O00472 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ELL2O00472 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ELL2O00472 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ELL2O00472 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ELL2O00472 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ELL2O00472 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ELL2O00472 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ELL2O00472 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ELL2O00472 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ELL2O00472 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ELL2O00472 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ELL2O00472 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ELL2O00472 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ELL2O00472 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ELL2O00472 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ELL2O00472 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ELL2O00472 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ELL2O00472 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ELL2O00472 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ELL2O00472 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ELL2O00472 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ELL2O00472 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ELL2O00472 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ELL2O00472 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ELL2O00472 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ELL2O00472 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ELL2O00472 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ELL2O00472 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ELL2O00472 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ELL2O00472 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ELL2O00472 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ELL2O00472 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ELL2O00472 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ELL2O00472 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ELL2O00472 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ELL2O00472 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ELL2O00472 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ELL2O00472 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ELL2O00472 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ELL2O00472 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ELL2O00472 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ELL2O00472 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ELL2O00472 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ELL2O00472 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ELL2O00472 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ELL2O00472 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ELL2O00472 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ELL2O00472 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ELL2O00472 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ELL2O00472 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ELL2O00472 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ELL2O00472 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ELL2O00472 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ELL2O00472 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ELL2O00472 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ELL2O00472 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ELL2O00472 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ELL2O00472 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ELL2O00472 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ELL2O00472 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ELL2O00472 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ELL2O00472 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ELL2O00472 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ELL2O00472 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ELL2O00472 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ELL2O00472 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ELL2O00472 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ELL2O00472 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ELL2O00472 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ELL2O00472 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ELL2O00472 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ELL2O00472 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ELL2O00472 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ELL2O00472 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ELL2O00472 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ELL2O00472 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ELL2O00472 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ELL2O00472 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ELL2O00472 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ELL2O00472 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ELL2O00472 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ELL2O00472 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ELL2O00472 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ELL2O00472 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ELL2O00472 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ELL2O00472 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ELL2O00472 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ELL2O00472 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms