Protein–RNA interactions for Protein: C9JSJ3

BHMG1, Basic helix-loop-helix and HMG box domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMG1C9JSJ3 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BHMG1C9JSJ3 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
BHMG1C9JSJ3 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BHMG1C9JSJ3 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BHMG1C9JSJ3 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BHMG1C9JSJ3 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BHMG1C9JSJ3 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
BHMG1C9JSJ3 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BHMG1C9JSJ3 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BHMG1C9JSJ3 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BHMG1C9JSJ3 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BHMG1C9JSJ3 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BHMG1C9JSJ3 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BHMG1C9JSJ3 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BHMG1C9JSJ3 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BHMG1C9JSJ3 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BHMG1C9JSJ3 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BHMG1C9JSJ3 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BHMG1C9JSJ3 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BHMG1C9JSJ3 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BHMG1C9JSJ3 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BHMG1C9JSJ3 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BHMG1C9JSJ3 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BHMG1C9JSJ3 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BHMG1C9JSJ3 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BHMG1C9JSJ3 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
BHMG1C9JSJ3 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
BHMG1C9JSJ3 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BHMG1C9JSJ3 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
BHMG1C9JSJ3 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BHMG1C9JSJ3 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BHMG1C9JSJ3 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BHMG1C9JSJ3 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BHMG1C9JSJ3 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BHMG1C9JSJ3 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BHMG1C9JSJ3 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
BHMG1C9JSJ3 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
BHMG1C9JSJ3 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BHMG1C9JSJ3 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BHMG1C9JSJ3 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BHMG1C9JSJ3 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BHMG1C9JSJ3 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BHMG1C9JSJ3 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BHMG1C9JSJ3 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
BHMG1C9JSJ3 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
BHMG1C9JSJ3 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
BHMG1C9JSJ3 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BHMG1C9JSJ3 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms