Protein–RNA interactions for Protein: B4DXG7

cDNA FLJ57652, highly similar to Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DXG7 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
B4DXG7 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
B4DXG7 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
B4DXG7 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
B4DXG7 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
B4DXG7 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
B4DXG7 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
B4DXG7 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
B4DXG7 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
B4DXG7 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
B4DXG7 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
B4DXG7 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
B4DXG7 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
B4DXG7 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
B4DXG7 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
B4DXG7 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
B4DXG7 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
B4DXG7 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
B4DXG7 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
B4DXG7 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
B4DXG7 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
B4DXG7 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
B4DXG7 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
B4DXG7 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
B4DXG7 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
B4DXG7 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
B4DXG7 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
B4DXG7 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
B4DXG7 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
B4DXG7 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
B4DXG7 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
B4DXG7 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
B4DXG7 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
B4DXG7 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
B4DXG7 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
B4DXG7 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
B4DXG7 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
B4DXG7 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
B4DXG7 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
B4DXG7 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
B4DXG7 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
B4DXG7 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
B4DXG7 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
B4DXG7 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
B4DXG7 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
B4DXG7 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
B4DXG7 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
B4DXG7 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
B4DXG7 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
B4DXG7 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
B4DXG7 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
B4DXG7 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
B4DXG7 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
B4DXG7 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
B4DXG7 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
B4DXG7 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
B4DXG7 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
B4DXG7 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
B4DXG7 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
B4DXG7 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
B4DXG7 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
B4DXG7 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
B4DXG7 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
B4DXG7 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
B4DXG7 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
B4DXG7 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
B4DXG7 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
B4DXG7 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
B4DXG7 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
B4DXG7 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
B4DXG7 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
B4DXG7 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
B4DXG7 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
B4DXG7 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
B4DXG7 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
B4DXG7 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
B4DXG7 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
B4DXG7 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
B4DXG7 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
B4DXG7 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
B4DXG7 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
B4DXG7 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
B4DXG7 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
B4DXG7 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
B4DXG7 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
B4DXG7 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
B4DXG7 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
B4DXG7 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
B4DXG7 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
B4DXG7 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
B4DXG7 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
B4DXG7 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
B4DXG7 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
B4DXG7 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
B4DXG7 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
B4DXG7 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
B4DXG7 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
B4DXG7 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
B4DXG7 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
B4DXG7 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms