Protein–RNA interactions for Protein: A8KAH6

HSPB2, Heat shock 27kDa protein 2, isoform CRA_a, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB2A8KAH6 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HSPB2A8KAH6 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HSPB2A8KAH6 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HSPB2A8KAH6 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HSPB2A8KAH6 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HSPB2A8KAH6 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HSPB2A8KAH6 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HSPB2A8KAH6 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HSPB2A8KAH6 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HSPB2A8KAH6 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HSPB2A8KAH6 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HSPB2A8KAH6 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HSPB2A8KAH6 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HSPB2A8KAH6 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HSPB2A8KAH6 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HSPB2A8KAH6 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HSPB2A8KAH6 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HSPB2A8KAH6 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HSPB2A8KAH6 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSPB2A8KAH6 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSPB2A8KAH6 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSPB2A8KAH6 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSPB2A8KAH6 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSPB2A8KAH6 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HSPB2A8KAH6 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSPB2A8KAH6 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSPB2A8KAH6 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSPB2A8KAH6 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSPB2A8KAH6 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSPB2A8KAH6 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSPB2A8KAH6 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSPB2A8KAH6 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSPB2A8KAH6 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSPB2A8KAH6 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSPB2A8KAH6 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSPB2A8KAH6 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSPB2A8KAH6 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSPB2A8KAH6 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSPB2A8KAH6 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSPB2A8KAH6 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HSPB2A8KAH6 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HSPB2A8KAH6 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HSPB2A8KAH6 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSPB2A8KAH6 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSPB2A8KAH6 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSPB2A8KAH6 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HSPB2A8KAH6 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSPB2A8KAH6 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HSPB2A8KAH6 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSPB2A8KAH6 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSPB2A8KAH6 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSPB2A8KAH6 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSPB2A8KAH6 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSPB2A8KAH6 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSPB2A8KAH6 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSPB2A8KAH6 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSPB2A8KAH6 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSPB2A8KAH6 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSPB2A8KAH6 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSPB2A8KAH6 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSPB2A8KAH6 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSPB2A8KAH6 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HSPB2A8KAH6 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSPB2A8KAH6 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSPB2A8KAH6 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSPB2A8KAH6 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSPB2A8KAH6 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSPB2A8KAH6 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSPB2A8KAH6 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSPB2A8KAH6 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSPB2A8KAH6 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSPB2A8KAH6 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HSPB2A8KAH6 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HSPB2A8KAH6 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HSPB2A8KAH6 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HSPB2A8KAH6 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HSPB2A8KAH6 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HSPB2A8KAH6 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HSPB2A8KAH6 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HSPB2A8KAH6 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HSPB2A8KAH6 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HSPB2A8KAH6 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HSPB2A8KAH6 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HSPB2A8KAH6 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HSPB2A8KAH6 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HSPB2A8KAH6 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HSPB2A8KAH6 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HSPB2A8KAH6 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HSPB2A8KAH6 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HSPB2A8KAH6 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HSPB2A8KAH6 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HSPB2A8KAH6 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HSPB2A8KAH6 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HSPB2A8KAH6 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HSPB2A8KAH6 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HSPB2A8KAH6 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HSPB2A8KAH6 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HSPB2A8KAH6 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HSPB2A8KAH6 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HSPB2A8KAH6 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms