Protein–RNA interactions for Protein: A6NNA2

SRRM3, Serine/arginine repetitive matrix protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM3A6NNA2 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SRRM3A6NNA2 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SRRM3A6NNA2 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRRM3A6NNA2 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRRM3A6NNA2 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRRM3A6NNA2 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRRM3A6NNA2 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRRM3A6NNA2 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRRM3A6NNA2 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SRRM3A6NNA2 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRRM3A6NNA2 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRRM3A6NNA2 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRRM3A6NNA2 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRRM3A6NNA2 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SRRM3A6NNA2 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRRM3A6NNA2 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRRM3A6NNA2 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRRM3A6NNA2 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRRM3A6NNA2 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRRM3A6NNA2 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SRRM3A6NNA2 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRRM3A6NNA2 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRRM3A6NNA2 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRRM3A6NNA2 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRRM3A6NNA2 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRRM3A6NNA2 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRRM3A6NNA2 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRRM3A6NNA2 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRRM3A6NNA2 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRRM3A6NNA2 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SRRM3A6NNA2 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRRM3A6NNA2 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRRM3A6NNA2 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SRRM3A6NNA2 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SRRM3A6NNA2 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SRRM3A6NNA2 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRRM3A6NNA2 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRRM3A6NNA2 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRRM3A6NNA2 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRRM3A6NNA2 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRRM3A6NNA2 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRRM3A6NNA2 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRRM3A6NNA2 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRRM3A6NNA2 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRRM3A6NNA2 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRRM3A6NNA2 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRRM3A6NNA2 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRRM3A6NNA2 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRRM3A6NNA2 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRRM3A6NNA2 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SRRM3A6NNA2 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SRRM3A6NNA2 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SRRM3A6NNA2 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SRRM3A6NNA2 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SRRM3A6NNA2 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SRRM3A6NNA2 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRRM3A6NNA2 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRRM3A6NNA2 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRRM3A6NNA2 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRRM3A6NNA2 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRRM3A6NNA2 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRRM3A6NNA2 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRRM3A6NNA2 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SRRM3A6NNA2 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRRM3A6NNA2 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRRM3A6NNA2 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRRM3A6NNA2 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRRM3A6NNA2 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRRM3A6NNA2 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRRM3A6NNA2 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRRM3A6NNA2 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRRM3A6NNA2 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRRM3A6NNA2 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRRM3A6NNA2 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRRM3A6NNA2 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRRM3A6NNA2 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRRM3A6NNA2 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRRM3A6NNA2 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRRM3A6NNA2 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRRM3A6NNA2 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRRM3A6NNA2 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRRM3A6NNA2 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRRM3A6NNA2 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRRM3A6NNA2 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRRM3A6NNA2 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRRM3A6NNA2 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRRM3A6NNA2 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRRM3A6NNA2 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRRM3A6NNA2 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRRM3A6NNA2 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRRM3A6NNA2 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRRM3A6NNA2 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRRM3A6NNA2 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRRM3A6NNA2 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRRM3A6NNA2 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRRM3A6NNA2 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRRM3A6NNA2 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRRM3A6NNA2 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRRM3A6NNA2 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRRM3A6NNA2 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms