Protein–RNA interactions for Protein: A5D8W1

CFAP69, Cilia- and flagella-associated protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP69A5D8W1 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CFAP69A5D8W1 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CFAP69A5D8W1 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CFAP69A5D8W1 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CFAP69A5D8W1 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CFAP69A5D8W1 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CFAP69A5D8W1 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CFAP69A5D8W1 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CFAP69A5D8W1 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CFAP69A5D8W1 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CFAP69A5D8W1 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CFAP69A5D8W1 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CFAP69A5D8W1 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CFAP69A5D8W1 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CFAP69A5D8W1 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CFAP69A5D8W1 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CFAP69A5D8W1 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CFAP69A5D8W1 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CFAP69A5D8W1 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CFAP69A5D8W1 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CFAP69A5D8W1 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CFAP69A5D8W1 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CFAP69A5D8W1 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CFAP69A5D8W1 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CFAP69A5D8W1 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CFAP69A5D8W1 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CFAP69A5D8W1 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CFAP69A5D8W1 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CFAP69A5D8W1 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CFAP69A5D8W1 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CFAP69A5D8W1 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CFAP69A5D8W1 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CFAP69A5D8W1 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CFAP69A5D8W1 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CFAP69A5D8W1 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CFAP69A5D8W1 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CFAP69A5D8W1 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CFAP69A5D8W1 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CFAP69A5D8W1 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CFAP69A5D8W1 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CFAP69A5D8W1 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CFAP69A5D8W1 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CFAP69A5D8W1 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CFAP69A5D8W1 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CFAP69A5D8W1 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CFAP69A5D8W1 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CFAP69A5D8W1 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CFAP69A5D8W1 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CFAP69A5D8W1 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CFAP69A5D8W1 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CFAP69A5D8W1 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CFAP69A5D8W1 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CFAP69A5D8W1 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CFAP69A5D8W1 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CFAP69A5D8W1 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CFAP69A5D8W1 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CFAP69A5D8W1 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CFAP69A5D8W1 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CFAP69A5D8W1 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CFAP69A5D8W1 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CFAP69A5D8W1 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CFAP69A5D8W1 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CFAP69A5D8W1 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CFAP69A5D8W1 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CFAP69A5D8W1 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CFAP69A5D8W1 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CFAP69A5D8W1 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CFAP69A5D8W1 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CFAP69A5D8W1 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CFAP69A5D8W1 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CFAP69A5D8W1 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CFAP69A5D8W1 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CFAP69A5D8W1 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CFAP69A5D8W1 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CFAP69A5D8W1 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CFAP69A5D8W1 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CFAP69A5D8W1 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CFAP69A5D8W1 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CFAP69A5D8W1 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CFAP69A5D8W1 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CFAP69A5D8W1 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CFAP69A5D8W1 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CFAP69A5D8W1 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CFAP69A5D8W1 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CFAP69A5D8W1 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CFAP69A5D8W1 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CFAP69A5D8W1 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CFAP69A5D8W1 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CFAP69A5D8W1 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CFAP69A5D8W1 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CFAP69A5D8W1 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CFAP69A5D8W1 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CFAP69A5D8W1 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CFAP69A5D8W1 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CFAP69A5D8W1 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CFAP69A5D8W1 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CFAP69A5D8W1 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CFAP69A5D8W1 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CFAP69A5D8W1 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CFAP69A5D8W1 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.4 ms