Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC78A2IDD5 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC78A2IDD5 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC78A2IDD5 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC78A2IDD5 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC78A2IDD5 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC78A2IDD5 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC78A2IDD5 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC78A2IDD5 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC78A2IDD5 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC78A2IDD5 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC78A2IDD5 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC78A2IDD5 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC78A2IDD5 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC78A2IDD5 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC78A2IDD5 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC78A2IDD5 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC78A2IDD5 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC78A2IDD5 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC78A2IDD5 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC78A2IDD5 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC78A2IDD5 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC78A2IDD5 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC78A2IDD5 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC78A2IDD5 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC78A2IDD5 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC78A2IDD5 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC78A2IDD5 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC78A2IDD5 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC78A2IDD5 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC78A2IDD5 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC78A2IDD5 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC78A2IDD5 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC78A2IDD5 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC78A2IDD5 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC78A2IDD5 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC78A2IDD5 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC78A2IDD5 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC78A2IDD5 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC78A2IDD5 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC78A2IDD5 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC78A2IDD5 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC78A2IDD5 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC78A2IDD5 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC78A2IDD5 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC78A2IDD5 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC78A2IDD5 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC78A2IDD5 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC78A2IDD5 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC78A2IDD5 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC78A2IDD5 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC78A2IDD5 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC78A2IDD5 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC78A2IDD5 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC78A2IDD5 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC78A2IDD5 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC78A2IDD5 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC78A2IDD5 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC78A2IDD5 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC78A2IDD5 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC78A2IDD5 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC78A2IDD5 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC78A2IDD5 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC78A2IDD5 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC78A2IDD5 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC78A2IDD5 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC78A2IDD5 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC78A2IDD5 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC78A2IDD5 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC78A2IDD5 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC78A2IDD5 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC78A2IDD5 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC78A2IDD5 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC78A2IDD5 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC78A2IDD5 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC78A2IDD5 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC78A2IDD5 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC78A2IDD5 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC78A2IDD5 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC78A2IDD5 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC78A2IDD5 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC78A2IDD5 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC78A2IDD5 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC78A2IDD5 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC78A2IDD5 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC78A2IDD5 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC78A2IDD5 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC78A2IDD5 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC78A2IDD5 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC78A2IDD5 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC78A2IDD5 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC78A2IDD5 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC78A2IDD5 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC78A2IDD5 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC78A2IDD5 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC78A2IDD5 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC78A2IDD5 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC78A2IDD5 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC78A2IDD5 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC78A2IDD5 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms