Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC00312Q9Y6C7 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.2 ms