Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4C0

NRXN3, Neurexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN3Q9Y4C0 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NRXN3Q9Y4C0 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NRXN3Q9Y4C0 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NRXN3Q9Y4C0 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NRXN3Q9Y4C0 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NRXN3Q9Y4C0 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
NRXN3Q9Y4C0 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NRXN3Q9Y4C0 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NRXN3Q9Y4C0 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
NRXN3Q9Y4C0 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NRXN3Q9Y4C0 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NRXN3Q9Y4C0 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NRXN3Q9Y4C0 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
NRXN3Q9Y4C0 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
NRXN3Q9Y4C0 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NRXN3Q9Y4C0 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NRXN3Q9Y4C0 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NRXN3Q9Y4C0 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NRXN3Q9Y4C0 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NRXN3Q9Y4C0 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
NRXN3Q9Y4C0 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NRXN3Q9Y4C0 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
NRXN3Q9Y4C0 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
NRXN3Q9Y4C0 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
NRXN3Q9Y4C0 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
NRXN3Q9Y4C0 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NRXN3Q9Y4C0 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NRXN3Q9Y4C0 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
NRXN3Q9Y4C0 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NRXN3Q9Y4C0 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NRXN3Q9Y4C0 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NRXN3Q9Y4C0 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NRXN3Q9Y4C0 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NRXN3Q9Y4C0 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NRXN3Q9Y4C0 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NRXN3Q9Y4C0 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NRXN3Q9Y4C0 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NRXN3Q9Y4C0 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NRXN3Q9Y4C0 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NRXN3Q9Y4C0 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NRXN3Q9Y4C0 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NRXN3Q9Y4C0 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NRXN3Q9Y4C0 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NRXN3Q9Y4C0 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NRXN3Q9Y4C0 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NRXN3Q9Y4C0 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NRXN3Q9Y4C0 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NRXN3Q9Y4C0 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NRXN3Q9Y4C0 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NRXN3Q9Y4C0 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NRXN3Q9Y4C0 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NRXN3Q9Y4C0 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NRXN3Q9Y4C0 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NRXN3Q9Y4C0 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NRXN3Q9Y4C0 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NRXN3Q9Y4C0 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NRXN3Q9Y4C0 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
NRXN3Q9Y4C0 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
NRXN3Q9Y4C0 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NRXN3Q9Y4C0 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NRXN3Q9Y4C0 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NRXN3Q9Y4C0 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NRXN3Q9Y4C0 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NRXN3Q9Y4C0 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NRXN3Q9Y4C0 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NRXN3Q9Y4C0 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NRXN3Q9Y4C0 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NRXN3Q9Y4C0 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NRXN3Q9Y4C0 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NRXN3Q9Y4C0 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NRXN3Q9Y4C0 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NRXN3Q9Y4C0 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NRXN3Q9Y4C0 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NRXN3Q9Y4C0 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NRXN3Q9Y4C0 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NRXN3Q9Y4C0 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NRXN3Q9Y4C0 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NRXN3Q9Y4C0 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NRXN3Q9Y4C0 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NRXN3Q9Y4C0 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NRXN3Q9Y4C0 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NRXN3Q9Y4C0 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NRXN3Q9Y4C0 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NRXN3Q9Y4C0 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NRXN3Q9Y4C0 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NRXN3Q9Y4C0 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NRXN3Q9Y4C0 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NRXN3Q9Y4C0 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NRXN3Q9Y4C0 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NRXN3Q9Y4C0 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NRXN3Q9Y4C0 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NRXN3Q9Y4C0 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NRXN3Q9Y4C0 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NRXN3Q9Y4C0 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NRXN3Q9Y4C0 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NRXN3Q9Y4C0 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NRXN3Q9Y4C0 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NRXN3Q9Y4C0 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NRXN3Q9Y4C0 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NRXN3Q9Y4C0 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms