Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A6

TMED5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED5Q9Y3A6 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMED5Q9Y3A6 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms