Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2D1

ATF5, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF5Q9Y2D1 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATF5Q9Y2D1 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATF5Q9Y2D1 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATF5Q9Y2D1 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATF5Q9Y2D1 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATF5Q9Y2D1 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATF5Q9Y2D1 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATF5Q9Y2D1 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATF5Q9Y2D1 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATF5Q9Y2D1 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATF5Q9Y2D1 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATF5Q9Y2D1 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATF5Q9Y2D1 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATF5Q9Y2D1 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATF5Q9Y2D1 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATF5Q9Y2D1 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATF5Q9Y2D1 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ATF5Q9Y2D1 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATF5Q9Y2D1 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATF5Q9Y2D1 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATF5Q9Y2D1 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATF5Q9Y2D1 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATF5Q9Y2D1 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATF5Q9Y2D1 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ATF5Q9Y2D1 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATF5Q9Y2D1 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATF5Q9Y2D1 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATF5Q9Y2D1 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATF5Q9Y2D1 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATF5Q9Y2D1 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATF5Q9Y2D1 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATF5Q9Y2D1 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATF5Q9Y2D1 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATF5Q9Y2D1 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATF5Q9Y2D1 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ATF5Q9Y2D1 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATF5Q9Y2D1 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATF5Q9Y2D1 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATF5Q9Y2D1 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATF5Q9Y2D1 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATF5Q9Y2D1 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATF5Q9Y2D1 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ATF5Q9Y2D1 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATF5Q9Y2D1 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATF5Q9Y2D1 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATF5Q9Y2D1 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATF5Q9Y2D1 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATF5Q9Y2D1 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATF5Q9Y2D1 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATF5Q9Y2D1 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATF5Q9Y2D1 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATF5Q9Y2D1 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATF5Q9Y2D1 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATF5Q9Y2D1 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATF5Q9Y2D1 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATF5Q9Y2D1 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATF5Q9Y2D1 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATF5Q9Y2D1 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATF5Q9Y2D1 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATF5Q9Y2D1 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATF5Q9Y2D1 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATF5Q9Y2D1 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATF5Q9Y2D1 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATF5Q9Y2D1 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATF5Q9Y2D1 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATF5Q9Y2D1 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATF5Q9Y2D1 EIF2S2P3-201ENST00000428356 999 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ATF5Q9Y2D1 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATF5Q9Y2D1 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATF5Q9Y2D1 AC016903.2-201ENST00000456384 326 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATF5Q9Y2D1 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATF5Q9Y2D1 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATF5Q9Y2D1 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATF5Q9Y2D1 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATF5Q9Y2D1 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATF5Q9Y2D1 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATF5Q9Y2D1 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATF5Q9Y2D1 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATF5Q9Y2D1 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATF5Q9Y2D1 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATF5Q9Y2D1 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATF5Q9Y2D1 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATF5Q9Y2D1 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATF5Q9Y2D1 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATF5Q9Y2D1 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATF5Q9Y2D1 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATF5Q9Y2D1 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATF5Q9Y2D1 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATF5Q9Y2D1 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATF5Q9Y2D1 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATF5Q9Y2D1 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATF5Q9Y2D1 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATF5Q9Y2D1 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATF5Q9Y2D1 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATF5Q9Y2D1 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATF5Q9Y2D1 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATF5Q9Y2D1 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATF5Q9Y2D1 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATF5Q9Y2D1 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATF5Q9Y2D1 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms