Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAK1Q9UPV9 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAK1Q9UPV9 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAK1Q9UPV9 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAK1Q9UPV9 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAK1Q9UPV9 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAK1Q9UPV9 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAK1Q9UPV9 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAK1Q9UPV9 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAK1Q9UPV9 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAK1Q9UPV9 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAK1Q9UPV9 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAK1Q9UPV9 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAK1Q9UPV9 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAK1Q9UPV9 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAK1Q9UPV9 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAK1Q9UPV9 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAK1Q9UPV9 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAK1Q9UPV9 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAK1Q9UPV9 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAK1Q9UPV9 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAK1Q9UPV9 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAK1Q9UPV9 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAK1Q9UPV9 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAK1Q9UPV9 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAK1Q9UPV9 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAK1Q9UPV9 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAK1Q9UPV9 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAK1Q9UPV9 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAK1Q9UPV9 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAK1Q9UPV9 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAK1Q9UPV9 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAK1Q9UPV9 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAK1Q9UPV9 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAK1Q9UPV9 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAK1Q9UPV9 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAK1Q9UPV9 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAK1Q9UPV9 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAK1Q9UPV9 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAK1Q9UPV9 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAK1Q9UPV9 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAK1Q9UPV9 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAK1Q9UPV9 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAK1Q9UPV9 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAK1Q9UPV9 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAK1Q9UPV9 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAK1Q9UPV9 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAK1Q9UPV9 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAK1Q9UPV9 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAK1Q9UPV9 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAK1Q9UPV9 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAK1Q9UPV9 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAK1Q9UPV9 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAK1Q9UPV9 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAK1Q9UPV9 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAK1Q9UPV9 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAK1Q9UPV9 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAK1Q9UPV9 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAK1Q9UPV9 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAK1Q9UPV9 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAK1Q9UPV9 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAK1Q9UPV9 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAK1Q9UPV9 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAK1Q9UPV9 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAK1Q9UPV9 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAK1Q9UPV9 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAK1Q9UPV9 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAK1Q9UPV9 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAK1Q9UPV9 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAK1Q9UPV9 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAK1Q9UPV9 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAK1Q9UPV9 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAK1Q9UPV9 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAK1Q9UPV9 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAK1Q9UPV9 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAK1Q9UPV9 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAK1Q9UPV9 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAK1Q9UPV9 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAK1Q9UPV9 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAK1Q9UPV9 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAK1Q9UPV9 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAK1Q9UPV9 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAK1Q9UPV9 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAK1Q9UPV9 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAK1Q9UPV9 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAK1Q9UPV9 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAK1Q9UPV9 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAK1Q9UPV9 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAK1Q9UPV9 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAK1Q9UPV9 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAK1Q9UPV9 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAK1Q9UPV9 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAK1Q9UPV9 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAK1Q9UPV9 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAK1Q9UPV9 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAK1Q9UPV9 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAK1Q9UPV9 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAK1Q9UPV9 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAK1Q9UPV9 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAK1Q9UPV9 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms