Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNRF3Q9ULT6 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNRF3Q9ULT6 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNRF3Q9ULT6 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNRF3Q9ULT6 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNRF3Q9ULT6 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNRF3Q9ULT6 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNRF3Q9ULT6 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNRF3Q9ULT6 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNRF3Q9ULT6 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNRF3Q9ULT6 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNRF3Q9ULT6 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNRF3Q9ULT6 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNRF3Q9ULT6 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNRF3Q9ULT6 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNRF3Q9ULT6 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNRF3Q9ULT6 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNRF3Q9ULT6 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNRF3Q9ULT6 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNRF3Q9ULT6 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNRF3Q9ULT6 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNRF3Q9ULT6 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNRF3Q9ULT6 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNRF3Q9ULT6 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNRF3Q9ULT6 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNRF3Q9ULT6 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNRF3Q9ULT6 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNRF3Q9ULT6 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNRF3Q9ULT6 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNRF3Q9ULT6 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNRF3Q9ULT6 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ZNRF3Q9ULT6 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ZNRF3Q9ULT6 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNRF3Q9ULT6 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNRF3Q9ULT6 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNRF3Q9ULT6 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNRF3Q9ULT6 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNRF3Q9ULT6 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNRF3Q9ULT6 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNRF3Q9ULT6 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNRF3Q9ULT6 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNRF3Q9ULT6 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNRF3Q9ULT6 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNRF3Q9ULT6 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNRF3Q9ULT6 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNRF3Q9ULT6 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNRF3Q9ULT6 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNRF3Q9ULT6 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNRF3Q9ULT6 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNRF3Q9ULT6 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNRF3Q9ULT6 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNRF3Q9ULT6 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNRF3Q9ULT6 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ZNRF3Q9ULT6 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ZNRF3Q9ULT6 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ZNRF3Q9ULT6 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ZNRF3Q9ULT6 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ZNRF3Q9ULT6 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ZNRF3Q9ULT6 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ZNRF3Q9ULT6 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
ZNRF3Q9ULT6 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ZNRF3Q9ULT6 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ZNRF3Q9ULT6 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ZNRF3Q9ULT6 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ZNRF3Q9ULT6 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ZNRF3Q9ULT6 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ZNRF3Q9ULT6 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ZNRF3Q9ULT6 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ZNRF3Q9ULT6 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ZNRF3Q9ULT6 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ZNRF3Q9ULT6 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
ZNRF3Q9ULT6 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ZNRF3Q9ULT6 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ZNRF3Q9ULT6 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ZNRF3Q9ULT6 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ZNRF3Q9ULT6 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ZNRF3Q9ULT6 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ZNRF3Q9ULT6 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ZNRF3Q9ULT6 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ZNRF3Q9ULT6 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ZNRF3Q9ULT6 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ZNRF3Q9ULT6 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ZNRF3Q9ULT6 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ZNRF3Q9ULT6 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ZNRF3Q9ULT6 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ZNRF3Q9ULT6 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
ZNRF3Q9ULT6 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ZNRF3Q9ULT6 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNRF3Q9ULT6 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNRF3Q9ULT6 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNRF3Q9ULT6 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNRF3Q9ULT6 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNRF3Q9ULT6 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNRF3Q9ULT6 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNRF3Q9ULT6 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNRF3Q9ULT6 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNRF3Q9ULT6 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNRF3Q9ULT6 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNRF3Q9ULT6 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNRF3Q9ULT6 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms