Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL42

PNMA2, Paraneoplastic antigen Ma2, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA2Q9UL42 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PNMA2Q9UL42 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PNMA2Q9UL42 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PNMA2Q9UL42 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PNMA2Q9UL42 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PNMA2Q9UL42 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PNMA2Q9UL42 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PNMA2Q9UL42 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PNMA2Q9UL42 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PNMA2Q9UL42 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PNMA2Q9UL42 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PNMA2Q9UL42 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PNMA2Q9UL42 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PNMA2Q9UL42 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PNMA2Q9UL42 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PNMA2Q9UL42 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PNMA2Q9UL42 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PNMA2Q9UL42 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PNMA2Q9UL42 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PNMA2Q9UL42 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PNMA2Q9UL42 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PNMA2Q9UL42 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PNMA2Q9UL42 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PNMA2Q9UL42 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PNMA2Q9UL42 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PNMA2Q9UL42 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PNMA2Q9UL42 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PNMA2Q9UL42 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PNMA2Q9UL42 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PNMA2Q9UL42 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PNMA2Q9UL42 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PNMA2Q9UL42 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PNMA2Q9UL42 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PNMA2Q9UL42 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PNMA2Q9UL42 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PNMA2Q9UL42 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PNMA2Q9UL42 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PNMA2Q9UL42 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PNMA2Q9UL42 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PNMA2Q9UL42 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PNMA2Q9UL42 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PNMA2Q9UL42 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PNMA2Q9UL42 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PNMA2Q9UL42 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PNMA2Q9UL42 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PNMA2Q9UL42 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PNMA2Q9UL42 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PNMA2Q9UL42 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PNMA2Q9UL42 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PNMA2Q9UL42 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PNMA2Q9UL42 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PNMA2Q9UL42 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PNMA2Q9UL42 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PNMA2Q9UL42 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PNMA2Q9UL42 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PNMA2Q9UL42 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PNMA2Q9UL42 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PNMA2Q9UL42 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PNMA2Q9UL42 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PNMA2Q9UL42 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PNMA2Q9UL42 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PNMA2Q9UL42 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PNMA2Q9UL42 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PNMA2Q9UL42 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PNMA2Q9UL42 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PNMA2Q9UL42 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PNMA2Q9UL42 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PNMA2Q9UL42 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PNMA2Q9UL42 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PNMA2Q9UL42 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PNMA2Q9UL42 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PNMA2Q9UL42 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PNMA2Q9UL42 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PNMA2Q9UL42 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PNMA2Q9UL42 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PNMA2Q9UL42 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PNMA2Q9UL42 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PNMA2Q9UL42 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PNMA2Q9UL42 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PNMA2Q9UL42 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PNMA2Q9UL42 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PNMA2Q9UL42 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PNMA2Q9UL42 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PNMA2Q9UL42 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PNMA2Q9UL42 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PNMA2Q9UL42 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PNMA2Q9UL42 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PNMA2Q9UL42 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PNMA2Q9UL42 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PNMA2Q9UL42 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PNMA2Q9UL42 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PNMA2Q9UL42 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PNMA2Q9UL42 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PNMA2Q9UL42 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PNMA2Q9UL42 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PNMA2Q9UL42 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PNMA2Q9UL42 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PNMA2Q9UL42 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PNMA2Q9UL42 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PNMA2Q9UL42 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms