Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MLH3Q9UHC1 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MLH3Q9UHC1 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MLH3Q9UHC1 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MLH3Q9UHC1 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
MLH3Q9UHC1 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MLH3Q9UHC1 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MLH3Q9UHC1 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MLH3Q9UHC1 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
MLH3Q9UHC1 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MLH3Q9UHC1 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MLH3Q9UHC1 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MLH3Q9UHC1 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MLH3Q9UHC1 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MLH3Q9UHC1 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MLH3Q9UHC1 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MLH3Q9UHC1 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MLH3Q9UHC1 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MLH3Q9UHC1 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MLH3Q9UHC1 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MLH3Q9UHC1 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MLH3Q9UHC1 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
MLH3Q9UHC1 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MLH3Q9UHC1 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
MLH3Q9UHC1 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MLH3Q9UHC1 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MLH3Q9UHC1 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MLH3Q9UHC1 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MLH3Q9UHC1 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MLH3Q9UHC1 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MLH3Q9UHC1 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MLH3Q9UHC1 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MLH3Q9UHC1 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MLH3Q9UHC1 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MLH3Q9UHC1 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MLH3Q9UHC1 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MLH3Q9UHC1 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MLH3Q9UHC1 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MLH3Q9UHC1 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MLH3Q9UHC1 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MLH3Q9UHC1 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MLH3Q9UHC1 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MLH3Q9UHC1 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MLH3Q9UHC1 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MLH3Q9UHC1 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
MLH3Q9UHC1 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MLH3Q9UHC1 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MLH3Q9UHC1 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MLH3Q9UHC1 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MLH3Q9UHC1 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MLH3Q9UHC1 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MLH3Q9UHC1 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MLH3Q9UHC1 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MLH3Q9UHC1 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MLH3Q9UHC1 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
MLH3Q9UHC1 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MLH3Q9UHC1 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MLH3Q9UHC1 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
MLH3Q9UHC1 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MLH3Q9UHC1 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MLH3Q9UHC1 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MLH3Q9UHC1 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MLH3Q9UHC1 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MLH3Q9UHC1 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MLH3Q9UHC1 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MLH3Q9UHC1 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MLH3Q9UHC1 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MLH3Q9UHC1 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MLH3Q9UHC1 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MLH3Q9UHC1 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MLH3Q9UHC1 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MLH3Q9UHC1 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MLH3Q9UHC1 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MLH3Q9UHC1 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
MLH3Q9UHC1 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MLH3Q9UHC1 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MLH3Q9UHC1 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MLH3Q9UHC1 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MLH3Q9UHC1 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
MLH3Q9UHC1 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MLH3Q9UHC1 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MLH3Q9UHC1 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MLH3Q9UHC1 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MLH3Q9UHC1 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MLH3Q9UHC1 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MLH3Q9UHC1 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MLH3Q9UHC1 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MLH3Q9UHC1 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MLH3Q9UHC1 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MLH3Q9UHC1 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MLH3Q9UHC1 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MLH3Q9UHC1 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MLH3Q9UHC1 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MLH3Q9UHC1 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MLH3Q9UHC1 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MLH3Q9UHC1 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MLH3Q9UHC1 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
MLH3Q9UHC1 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
MLH3Q9UHC1 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
MLH3Q9UHC1 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms