Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CGGBP1Q9UFW8 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
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