Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0M6

H2AFY2, Core histone macro-H2A.2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFY2Q9P0M6 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
H2AFY2Q9P0M6 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2AFY2Q9P0M6 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2AFY2Q9P0M6 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2AFY2Q9P0M6 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2AFY2Q9P0M6 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2AFY2Q9P0M6 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2AFY2Q9P0M6 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2AFY2Q9P0M6 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2AFY2Q9P0M6 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2AFY2Q9P0M6 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2AFY2Q9P0M6 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2AFY2Q9P0M6 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
H2AFY2Q9P0M6 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
H2AFY2Q9P0M6 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
H2AFY2Q9P0M6 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
H2AFY2Q9P0M6 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
H2AFY2Q9P0M6 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
H2AFY2Q9P0M6 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
H2AFY2Q9P0M6 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
H2AFY2Q9P0M6 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
H2AFY2Q9P0M6 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2AFY2Q9P0M6 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2AFY2Q9P0M6 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2AFY2Q9P0M6 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2AFY2Q9P0M6 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2AFY2Q9P0M6 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2AFY2Q9P0M6 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2AFY2Q9P0M6 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2AFY2Q9P0M6 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2AFY2Q9P0M6 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2AFY2Q9P0M6 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2AFY2Q9P0M6 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2AFY2Q9P0M6 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
H2AFY2Q9P0M6 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
H2AFY2Q9P0M6 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
H2AFY2Q9P0M6 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2AFY2Q9P0M6 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2AFY2Q9P0M6 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2AFY2Q9P0M6 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2AFY2Q9P0M6 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2AFY2Q9P0M6 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2AFY2Q9P0M6 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
H2AFY2Q9P0M6 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2AFY2Q9P0M6 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2AFY2Q9P0M6 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2AFY2Q9P0M6 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2AFY2Q9P0M6 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2AFY2Q9P0M6 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2AFY2Q9P0M6 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2AFY2Q9P0M6 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2AFY2Q9P0M6 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2AFY2Q9P0M6 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2AFY2Q9P0M6 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2AFY2Q9P0M6 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2AFY2Q9P0M6 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2AFY2Q9P0M6 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2AFY2Q9P0M6 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2AFY2Q9P0M6 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2AFY2Q9P0M6 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2AFY2Q9P0M6 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2AFY2Q9P0M6 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2AFY2Q9P0M6 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2AFY2Q9P0M6 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2AFY2Q9P0M6 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2AFY2Q9P0M6 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2AFY2Q9P0M6 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
H2AFY2Q9P0M6 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2AFY2Q9P0M6 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
H2AFY2Q9P0M6 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2AFY2Q9P0M6 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2AFY2Q9P0M6 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2AFY2Q9P0M6 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2AFY2Q9P0M6 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
H2AFY2Q9P0M6 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2AFY2Q9P0M6 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2AFY2Q9P0M6 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2AFY2Q9P0M6 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2AFY2Q9P0M6 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2AFY2Q9P0M6 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2AFY2Q9P0M6 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2AFY2Q9P0M6 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2AFY2Q9P0M6 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2AFY2Q9P0M6 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2AFY2Q9P0M6 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2AFY2Q9P0M6 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2AFY2Q9P0M6 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2AFY2Q9P0M6 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2AFY2Q9P0M6 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2AFY2Q9P0M6 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2AFY2Q9P0M6 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2AFY2Q9P0M6 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2AFY2Q9P0M6 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2AFY2Q9P0M6 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2AFY2Q9P0M6 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2AFY2Q9P0M6 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2AFY2Q9P0M6 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2AFY2Q9P0M6 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2AFY2Q9P0M6 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2AFY2Q9P0M6 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms