Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GDE1Q9NZC3 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
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