Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX63

CHCHD3, MICOS complex subunit MIC19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD3Q9NX63 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CHCHD3Q9NX63 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CHCHD3Q9NX63 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CHCHD3Q9NX63 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CHCHD3Q9NX63 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CHCHD3Q9NX63 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CHCHD3Q9NX63 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHCHD3Q9NX63 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHCHD3Q9NX63 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHCHD3Q9NX63 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHCHD3Q9NX63 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHCHD3Q9NX63 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CHCHD3Q9NX63 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHCHD3Q9NX63 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CHCHD3Q9NX63 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHCHD3Q9NX63 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHCHD3Q9NX63 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHCHD3Q9NX63 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHCHD3Q9NX63 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHCHD3Q9NX63 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHCHD3Q9NX63 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CHCHD3Q9NX63 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHCHD3Q9NX63 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHCHD3Q9NX63 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHCHD3Q9NX63 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHCHD3Q9NX63 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHCHD3Q9NX63 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHCHD3Q9NX63 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHCHD3Q9NX63 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHCHD3Q9NX63 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHCHD3Q9NX63 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHCHD3Q9NX63 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHCHD3Q9NX63 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHCHD3Q9NX63 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHCHD3Q9NX63 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHCHD3Q9NX63 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHCHD3Q9NX63 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHCHD3Q9NX63 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHCHD3Q9NX63 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHCHD3Q9NX63 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHCHD3Q9NX63 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CHCHD3Q9NX63 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CHCHD3Q9NX63 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHCHD3Q9NX63 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHCHD3Q9NX63 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHCHD3Q9NX63 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHCHD3Q9NX63 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHCHD3Q9NX63 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHCHD3Q9NX63 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHCHD3Q9NX63 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHCHD3Q9NX63 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHCHD3Q9NX63 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHCHD3Q9NX63 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
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