Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU39

FOXD4L1, Forkhead box protein D4-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L1Q9NU39 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 AL355432.1-201ENST00000522960 564 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 AC090503.2-201ENST00000551135 981 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 AC002558.2-201ENST00000572193 673 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 AC017076.1-201ENST00000607613 578 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 BTG4-203ENST00000525791 1394 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 AL390879.2-204ENST00000438602 582 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 AC005534.1-201ENST00000455709 742 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 FCAR-203ENST00000355524 1483 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 ABI1-206ENST00000376140 1446 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 AC012454.1-201ENST00000443948 995 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 AL034374.2-201ENST00000605281 548 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms