Protein–RNA interactions for Protein: Q9NST1

PNPLA3, Patatin-like phospholipase domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA3Q9NST1 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PNPLA3Q9NST1 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PNPLA3Q9NST1 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PNPLA3Q9NST1 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PNPLA3Q9NST1 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PNPLA3Q9NST1 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PNPLA3Q9NST1 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PNPLA3Q9NST1 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PNPLA3Q9NST1 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PNPLA3Q9NST1 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PNPLA3Q9NST1 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PNPLA3Q9NST1 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PNPLA3Q9NST1 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PNPLA3Q9NST1 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PNPLA3Q9NST1 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PNPLA3Q9NST1 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PNPLA3Q9NST1 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PNPLA3Q9NST1 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms