Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ7

PCDHB16, Protocadherin beta-16, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB16Q9NRJ7 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCDHB16Q9NRJ7 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms