Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF9

POLE3, DNA polymerase epsilon subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLE3Q9NRF9 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms