Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY66

KDM5D, Lysine-specific demethylase 5D, humanhuman

Predictions only

Length 1,539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5DQ9BY66 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KDM5DQ9BY66 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KDM5DQ9BY66 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KDM5DQ9BY66 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KDM5DQ9BY66 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KDM5DQ9BY66 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KDM5DQ9BY66 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KDM5DQ9BY66 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KDM5DQ9BY66 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KDM5DQ9BY66 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KDM5DQ9BY66 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KDM5DQ9BY66 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KDM5DQ9BY66 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KDM5DQ9BY66 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KDM5DQ9BY66 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
KDM5DQ9BY66 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KDM5DQ9BY66 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KDM5DQ9BY66 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KDM5DQ9BY66 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KDM5DQ9BY66 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KDM5DQ9BY66 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KDM5DQ9BY66 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KDM5DQ9BY66 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KDM5DQ9BY66 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KDM5DQ9BY66 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KDM5DQ9BY66 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KDM5DQ9BY66 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KDM5DQ9BY66 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KDM5DQ9BY66 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KDM5DQ9BY66 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KDM5DQ9BY66 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KDM5DQ9BY66 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KDM5DQ9BY66 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KDM5DQ9BY66 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KDM5DQ9BY66 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KDM5DQ9BY66 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KDM5DQ9BY66 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KDM5DQ9BY66 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KDM5DQ9BY66 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KDM5DQ9BY66 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KDM5DQ9BY66 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KDM5DQ9BY66 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
KDM5DQ9BY66 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KDM5DQ9BY66 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KDM5DQ9BY66 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KDM5DQ9BY66 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KDM5DQ9BY66 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KDM5DQ9BY66 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KDM5DQ9BY66 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KDM5DQ9BY66 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KDM5DQ9BY66 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KDM5DQ9BY66 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
KDM5DQ9BY66 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KDM5DQ9BY66 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KDM5DQ9BY66 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
KDM5DQ9BY66 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KDM5DQ9BY66 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KDM5DQ9BY66 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KDM5DQ9BY66 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KDM5DQ9BY66 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KDM5DQ9BY66 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KDM5DQ9BY66 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KDM5DQ9BY66 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KDM5DQ9BY66 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KDM5DQ9BY66 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KDM5DQ9BY66 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KDM5DQ9BY66 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KDM5DQ9BY66 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
KDM5DQ9BY66 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KDM5DQ9BY66 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KDM5DQ9BY66 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KDM5DQ9BY66 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KDM5DQ9BY66 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KDM5DQ9BY66 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KDM5DQ9BY66 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KDM5DQ9BY66 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KDM5DQ9BY66 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KDM5DQ9BY66 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
KDM5DQ9BY66 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KDM5DQ9BY66 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KDM5DQ9BY66 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KDM5DQ9BY66 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KDM5DQ9BY66 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KDM5DQ9BY66 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KDM5DQ9BY66 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KDM5DQ9BY66 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KDM5DQ9BY66 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KDM5DQ9BY66 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KDM5DQ9BY66 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KDM5DQ9BY66 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
KDM5DQ9BY66 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KDM5DQ9BY66 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KDM5DQ9BY66 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
KDM5DQ9BY66 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KDM5DQ9BY66 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KDM5DQ9BY66 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KDM5DQ9BY66 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
KDM5DQ9BY66 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KDM5DQ9BY66 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KDM5DQ9BY66 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms