Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SCAPERQ9BY12 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SCAPERQ9BY12 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SCAPERQ9BY12 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SCAPERQ9BY12 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SCAPERQ9BY12 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SCAPERQ9BY12 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SCAPERQ9BY12 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SCAPERQ9BY12 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SCAPERQ9BY12 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SCAPERQ9BY12 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SCAPERQ9BY12 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SCAPERQ9BY12 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SCAPERQ9BY12 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SCAPERQ9BY12 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SCAPERQ9BY12 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SCAPERQ9BY12 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SCAPERQ9BY12 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SCAPERQ9BY12 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SCAPERQ9BY12 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SCAPERQ9BY12 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SCAPERQ9BY12 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SCAPERQ9BY12 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SCAPERQ9BY12 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SCAPERQ9BY12 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SCAPERQ9BY12 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SCAPERQ9BY12 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SCAPERQ9BY12 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SCAPERQ9BY12 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SCAPERQ9BY12 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SCAPERQ9BY12 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SCAPERQ9BY12 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SCAPERQ9BY12 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SCAPERQ9BY12 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SCAPERQ9BY12 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SCAPERQ9BY12 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SCAPERQ9BY12 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SCAPERQ9BY12 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SCAPERQ9BY12 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SCAPERQ9BY12 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SCAPERQ9BY12 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SCAPERQ9BY12 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SCAPERQ9BY12 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SCAPERQ9BY12 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SCAPERQ9BY12 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SCAPERQ9BY12 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SCAPERQ9BY12 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SCAPERQ9BY12 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SCAPERQ9BY12 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SCAPERQ9BY12 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SCAPERQ9BY12 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SCAPERQ9BY12 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
SCAPERQ9BY12 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SCAPERQ9BY12 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SCAPERQ9BY12 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SCAPERQ9BY12 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
SCAPERQ9BY12 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SCAPERQ9BY12 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SCAPERQ9BY12 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SCAPERQ9BY12 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SCAPERQ9BY12 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SCAPERQ9BY12 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SCAPERQ9BY12 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SCAPERQ9BY12 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SCAPERQ9BY12 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SCAPERQ9BY12 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SCAPERQ9BY12 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SCAPERQ9BY12 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SCAPERQ9BY12 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SCAPERQ9BY12 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SCAPERQ9BY12 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SCAPERQ9BY12 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SCAPERQ9BY12 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SCAPERQ9BY12 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SCAPERQ9BY12 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SCAPERQ9BY12 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SCAPERQ9BY12 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SCAPERQ9BY12 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SCAPERQ9BY12 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SCAPERQ9BY12 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SCAPERQ9BY12 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SCAPERQ9BY12 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SCAPERQ9BY12 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SCAPERQ9BY12 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SCAPERQ9BY12 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SCAPERQ9BY12 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SCAPERQ9BY12 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SCAPERQ9BY12 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SCAPERQ9BY12 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SCAPERQ9BY12 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SCAPERQ9BY12 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SCAPERQ9BY12 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SCAPERQ9BY12 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SCAPERQ9BY12 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SCAPERQ9BY12 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SCAPERQ9BY12 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SCAPERQ9BY12 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SCAPERQ9BY12 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SCAPERQ9BY12 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SCAPERQ9BY12 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms