Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
RBBP8Q99708 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.3 ms