Protein–RNA interactions for Protein: Q96QT6

PHF12, PHD finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF12Q96QT6 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 OR6C65-201ENST00000379665 1076 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 AL121949.1-201ENST00000402043 968 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 MTND4LP31-201ENST00000514859 294 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 AC020656.1-201ENST00000548900 599 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 HIST2H4B-201ENST00000579512 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 ZNF92P2-201ENST00000600543 1059 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 CAB39P1-201ENST00000502277 460 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 ETFRF1-202ENST00000553788 708 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 AP001198.2-201ENST00000593121 466 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 AL451086.1-201ENST00000605596 223 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 AC013470.4-201ENST00000619978 986 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms