Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARXQ96QS3 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARXQ96QS3 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARXQ96QS3 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARXQ96QS3 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARXQ96QS3 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARXQ96QS3 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARXQ96QS3 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARXQ96QS3 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARXQ96QS3 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARXQ96QS3 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARXQ96QS3 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARXQ96QS3 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARXQ96QS3 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARXQ96QS3 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ARXQ96QS3 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARXQ96QS3 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ARXQ96QS3 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARXQ96QS3 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARXQ96QS3 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARXQ96QS3 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARXQ96QS3 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARXQ96QS3 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARXQ96QS3 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARXQ96QS3 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ARXQ96QS3 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ARXQ96QS3 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
ARXQ96QS3 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
ARXQ96QS3 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ARXQ96QS3 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ARXQ96QS3 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ARXQ96QS3 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARXQ96QS3 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms