Protein–RNA interactions for Protein: Q96QD8

SLC38A2, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A2Q96QD8 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC38A2Q96QD8 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms