Protein–RNA interactions for Protein: Q96LY2

CCDC74B, Coiled-coil domain-containing protein 74B, humanhuman

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC74BQ96LY2 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC74BQ96LY2 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC74BQ96LY2 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC74BQ96LY2 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC74BQ96LY2 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC74BQ96LY2 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC74BQ96LY2 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC74BQ96LY2 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC74BQ96LY2 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC74BQ96LY2 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC74BQ96LY2 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC74BQ96LY2 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC74BQ96LY2 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC74BQ96LY2 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC74BQ96LY2 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC74BQ96LY2 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC74BQ96LY2 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC74BQ96LY2 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC74BQ96LY2 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC74BQ96LY2 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC74BQ96LY2 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC74BQ96LY2 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC74BQ96LY2 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC74BQ96LY2 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC74BQ96LY2 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC74BQ96LY2 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC74BQ96LY2 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC74BQ96LY2 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC74BQ96LY2 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC74BQ96LY2 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC74BQ96LY2 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC74BQ96LY2 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC74BQ96LY2 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC74BQ96LY2 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC74BQ96LY2 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC74BQ96LY2 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC74BQ96LY2 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC74BQ96LY2 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC74BQ96LY2 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC74BQ96LY2 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC74BQ96LY2 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC74BQ96LY2 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC74BQ96LY2 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC74BQ96LY2 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC74BQ96LY2 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC74BQ96LY2 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC74BQ96LY2 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC74BQ96LY2 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC74BQ96LY2 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC74BQ96LY2 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC74BQ96LY2 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC74BQ96LY2 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC74BQ96LY2 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC74BQ96LY2 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC74BQ96LY2 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC74BQ96LY2 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC74BQ96LY2 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC74BQ96LY2 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC74BQ96LY2 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC74BQ96LY2 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC74BQ96LY2 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC74BQ96LY2 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC74BQ96LY2 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC74BQ96LY2 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC74BQ96LY2 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC74BQ96LY2 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC74BQ96LY2 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC74BQ96LY2 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC74BQ96LY2 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC74BQ96LY2 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC74BQ96LY2 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CCDC74BQ96LY2 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CCDC74BQ96LY2 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC74BQ96LY2 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC74BQ96LY2 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC74BQ96LY2 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC74BQ96LY2 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC74BQ96LY2 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC74BQ96LY2 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC74BQ96LY2 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC74BQ96LY2 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC74BQ96LY2 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC74BQ96LY2 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC74BQ96LY2 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC74BQ96LY2 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC74BQ96LY2 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC74BQ96LY2 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC74BQ96LY2 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC74BQ96LY2 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC74BQ96LY2 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC74BQ96LY2 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC74BQ96LY2 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC74BQ96LY2 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC74BQ96LY2 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC74BQ96LY2 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC74BQ96LY2 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC74BQ96LY2 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC74BQ96LY2 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC74BQ96LY2 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC74BQ96LY2 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms