Protein–RNA interactions for Protein: Q96L91

EP400, E1A-binding protein p400, humanhuman

Predictions only

Length 3,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP400Q96L91 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EP400Q96L91 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EP400Q96L91 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EP400Q96L91 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EP400Q96L91 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EP400Q96L91 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EP400Q96L91 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
EP400Q96L91 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EP400Q96L91 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
EP400Q96L91 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EP400Q96L91 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EP400Q96L91 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EP400Q96L91 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EP400Q96L91 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EP400Q96L91 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EP400Q96L91 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EP400Q96L91 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
EP400Q96L91 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EP400Q96L91 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EP400Q96L91 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EP400Q96L91 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EP400Q96L91 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EP400Q96L91 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EP400Q96L91 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EP400Q96L91 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EP400Q96L91 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EP400Q96L91 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EP400Q96L91 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EP400Q96L91 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EP400Q96L91 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EP400Q96L91 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
EP400Q96L91 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EP400Q96L91 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EP400Q96L91 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EP400Q96L91 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EP400Q96L91 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EP400Q96L91 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EP400Q96L91 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EP400Q96L91 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EP400Q96L91 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EP400Q96L91 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EP400Q96L91 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EP400Q96L91 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EP400Q96L91 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
EP400Q96L91 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EP400Q96L91 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EP400Q96L91 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EP400Q96L91 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EP400Q96L91 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EP400Q96L91 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EP400Q96L91 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EP400Q96L91 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EP400Q96L91 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EP400Q96L91 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EP400Q96L91 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EP400Q96L91 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EP400Q96L91 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EP400Q96L91 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EP400Q96L91 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EP400Q96L91 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EP400Q96L91 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EP400Q96L91 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
EP400Q96L91 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EP400Q96L91 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EP400Q96L91 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EP400Q96L91 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
EP400Q96L91 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EP400Q96L91 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EP400Q96L91 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
EP400Q96L91 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EP400Q96L91 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EP400Q96L91 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EP400Q96L91 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EP400Q96L91 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EP400Q96L91 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EP400Q96L91 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EP400Q96L91 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EP400Q96L91 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EP400Q96L91 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EP400Q96L91 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
EP400Q96L91 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EP400Q96L91 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EP400Q96L91 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
EP400Q96L91 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EP400Q96L91 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EP400Q96L91 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EP400Q96L91 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EP400Q96L91 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EP400Q96L91 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EP400Q96L91 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
EP400Q96L91 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EP400Q96L91 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EP400Q96L91 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EP400Q96L91 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EP400Q96L91 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EP400Q96L91 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EP400Q96L91 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EP400Q96L91 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EP400Q96L91 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EP400Q96L91 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms