Protein–RNA interactions for Protein: Q96JS3

PGBD1, PiggyBac transposable element-derived protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD1Q96JS3 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PGBD1Q96JS3 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PGBD1Q96JS3 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PGBD1Q96JS3 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PGBD1Q96JS3 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PGBD1Q96JS3 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PGBD1Q96JS3 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PGBD1Q96JS3 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PGBD1Q96JS3 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PGBD1Q96JS3 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PGBD1Q96JS3 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PGBD1Q96JS3 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PGBD1Q96JS3 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PGBD1Q96JS3 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PGBD1Q96JS3 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PGBD1Q96JS3 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PGBD1Q96JS3 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PGBD1Q96JS3 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PGBD1Q96JS3 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PGBD1Q96JS3 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PGBD1Q96JS3 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PGBD1Q96JS3 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PGBD1Q96JS3 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PGBD1Q96JS3 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PGBD1Q96JS3 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PGBD1Q96JS3 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PGBD1Q96JS3 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PGBD1Q96JS3 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PGBD1Q96JS3 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PGBD1Q96JS3 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PGBD1Q96JS3 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PGBD1Q96JS3 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PGBD1Q96JS3 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PGBD1Q96JS3 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PGBD1Q96JS3 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PGBD1Q96JS3 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PGBD1Q96JS3 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PGBD1Q96JS3 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PGBD1Q96JS3 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PGBD1Q96JS3 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PGBD1Q96JS3 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PGBD1Q96JS3 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PGBD1Q96JS3 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PGBD1Q96JS3 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PGBD1Q96JS3 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PGBD1Q96JS3 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PGBD1Q96JS3 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PGBD1Q96JS3 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PGBD1Q96JS3 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PGBD1Q96JS3 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PGBD1Q96JS3 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PGBD1Q96JS3 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PGBD1Q96JS3 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PGBD1Q96JS3 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PGBD1Q96JS3 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PGBD1Q96JS3 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PGBD1Q96JS3 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PGBD1Q96JS3 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PGBD1Q96JS3 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PGBD1Q96JS3 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PGBD1Q96JS3 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PGBD1Q96JS3 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PGBD1Q96JS3 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PGBD1Q96JS3 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PGBD1Q96JS3 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PGBD1Q96JS3 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PGBD1Q96JS3 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PGBD1Q96JS3 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PGBD1Q96JS3 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PGBD1Q96JS3 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PGBD1Q96JS3 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PGBD1Q96JS3 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PGBD1Q96JS3 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PGBD1Q96JS3 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PGBD1Q96JS3 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PGBD1Q96JS3 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PGBD1Q96JS3 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PGBD1Q96JS3 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PGBD1Q96JS3 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PGBD1Q96JS3 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PGBD1Q96JS3 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PGBD1Q96JS3 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PGBD1Q96JS3 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PGBD1Q96JS3 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PGBD1Q96JS3 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PGBD1Q96JS3 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PGBD1Q96JS3 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PGBD1Q96JS3 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PGBD1Q96JS3 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PGBD1Q96JS3 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PGBD1Q96JS3 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PGBD1Q96JS3 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PGBD1Q96JS3 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PGBD1Q96JS3 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PGBD1Q96JS3 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PGBD1Q96JS3 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PGBD1Q96JS3 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PGBD1Q96JS3 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PGBD1Q96JS3 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PGBD1Q96JS3 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms