Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN8

NEURL4, Neuralized-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,562 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEURL4Q96JN8 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NEURL4Q96JN8 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NEURL4Q96JN8 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NEURL4Q96JN8 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEURL4Q96JN8 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEURL4Q96JN8 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEURL4Q96JN8 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEURL4Q96JN8 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NEURL4Q96JN8 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEURL4Q96JN8 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEURL4Q96JN8 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEURL4Q96JN8 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEURL4Q96JN8 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEURL4Q96JN8 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEURL4Q96JN8 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEURL4Q96JN8 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEURL4Q96JN8 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEURL4Q96JN8 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEURL4Q96JN8 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEURL4Q96JN8 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEURL4Q96JN8 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEURL4Q96JN8 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEURL4Q96JN8 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEURL4Q96JN8 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEURL4Q96JN8 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEURL4Q96JN8 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEURL4Q96JN8 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEURL4Q96JN8 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEURL4Q96JN8 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEURL4Q96JN8 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEURL4Q96JN8 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEURL4Q96JN8 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEURL4Q96JN8 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEURL4Q96JN8 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEURL4Q96JN8 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEURL4Q96JN8 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEURL4Q96JN8 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEURL4Q96JN8 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEURL4Q96JN8 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEURL4Q96JN8 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEURL4Q96JN8 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEURL4Q96JN8 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NEURL4Q96JN8 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEURL4Q96JN8 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEURL4Q96JN8 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEURL4Q96JN8 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NEURL4Q96JN8 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEURL4Q96JN8 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEURL4Q96JN8 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEURL4Q96JN8 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEURL4Q96JN8 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEURL4Q96JN8 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEURL4Q96JN8 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEURL4Q96JN8 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEURL4Q96JN8 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEURL4Q96JN8 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEURL4Q96JN8 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEURL4Q96JN8 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEURL4Q96JN8 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEURL4Q96JN8 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEURL4Q96JN8 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NEURL4Q96JN8 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEURL4Q96JN8 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEURL4Q96JN8 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEURL4Q96JN8 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEURL4Q96JN8 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEURL4Q96JN8 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEURL4Q96JN8 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEURL4Q96JN8 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEURL4Q96JN8 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEURL4Q96JN8 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEURL4Q96JN8 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEURL4Q96JN8 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEURL4Q96JN8 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEURL4Q96JN8 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEURL4Q96JN8 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEURL4Q96JN8 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEURL4Q96JN8 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEURL4Q96JN8 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
NEURL4Q96JN8 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEURL4Q96JN8 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
NEURL4Q96JN8 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
NEURL4Q96JN8 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEURL4Q96JN8 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEURL4Q96JN8 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
NEURL4Q96JN8 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
NEURL4Q96JN8 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEURL4Q96JN8 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEURL4Q96JN8 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEURL4Q96JN8 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEURL4Q96JN8 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEURL4Q96JN8 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEURL4Q96JN8 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEURL4Q96JN8 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEURL4Q96JN8 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEURL4Q96JN8 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEURL4Q96JN8 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
NEURL4Q96JN8 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEURL4Q96JN8 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEURL4Q96JN8 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms