Protein–RNA interactions for Protein: Q96J65

ABCC12, Multidrug resistance-associated protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC12Q96J65 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ABCC12Q96J65 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ABCC12Q96J65 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ABCC12Q96J65 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ABCC12Q96J65 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ABCC12Q96J65 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ABCC12Q96J65 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ABCC12Q96J65 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ABCC12Q96J65 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ABCC12Q96J65 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ABCC12Q96J65 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ABCC12Q96J65 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ABCC12Q96J65 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ABCC12Q96J65 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ABCC12Q96J65 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ABCC12Q96J65 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ABCC12Q96J65 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ABCC12Q96J65 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ABCC12Q96J65 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ABCC12Q96J65 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ABCC12Q96J65 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ABCC12Q96J65 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ABCC12Q96J65 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ABCC12Q96J65 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ABCC12Q96J65 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ABCC12Q96J65 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ABCC12Q96J65 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ABCC12Q96J65 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ABCC12Q96J65 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ABCC12Q96J65 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ABCC12Q96J65 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ABCC12Q96J65 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ABCC12Q96J65 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ABCC12Q96J65 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ABCC12Q96J65 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ABCC12Q96J65 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ABCC12Q96J65 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ABCC12Q96J65 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ABCC12Q96J65 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ABCC12Q96J65 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ABCC12Q96J65 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ABCC12Q96J65 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ABCC12Q96J65 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ABCC12Q96J65 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ABCC12Q96J65 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ABCC12Q96J65 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ABCC12Q96J65 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ABCC12Q96J65 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ABCC12Q96J65 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ABCC12Q96J65 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ABCC12Q96J65 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ABCC12Q96J65 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ABCC12Q96J65 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ABCC12Q96J65 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ABCC12Q96J65 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ABCC12Q96J65 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ABCC12Q96J65 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ABCC12Q96J65 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ABCC12Q96J65 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ABCC12Q96J65 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ABCC12Q96J65 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ABCC12Q96J65 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ABCC12Q96J65 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ABCC12Q96J65 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ABCC12Q96J65 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ABCC12Q96J65 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ABCC12Q96J65 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ABCC12Q96J65 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ABCC12Q96J65 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ABCC12Q96J65 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ABCC12Q96J65 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ABCC12Q96J65 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ABCC12Q96J65 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ABCC12Q96J65 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ABCC12Q96J65 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ABCC12Q96J65 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ABCC12Q96J65 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ABCC12Q96J65 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ABCC12Q96J65 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ABCC12Q96J65 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ABCC12Q96J65 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ABCC12Q96J65 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ABCC12Q96J65 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ABCC12Q96J65 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ABCC12Q96J65 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ABCC12Q96J65 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ABCC12Q96J65 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ABCC12Q96J65 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ABCC12Q96J65 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ABCC12Q96J65 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ABCC12Q96J65 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ABCC12Q96J65 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ABCC12Q96J65 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ABCC12Q96J65 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ABCC12Q96J65 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ABCC12Q96J65 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ABCC12Q96J65 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ABCC12Q96J65 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ABCC12Q96J65 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ABCC12Q96J65 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms