Protein–RNA interactions for Protein: Q96DT6

ATG4C, Cysteine protease ATG4C, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4CQ96DT6 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ATG4CQ96DT6 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATG4CQ96DT6 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATG4CQ96DT6 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATG4CQ96DT6 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATG4CQ96DT6 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATG4CQ96DT6 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATG4CQ96DT6 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATG4CQ96DT6 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATG4CQ96DT6 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATG4CQ96DT6 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG4CQ96DT6 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG4CQ96DT6 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG4CQ96DT6 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG4CQ96DT6 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG4CQ96DT6 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG4CQ96DT6 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG4CQ96DT6 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG4CQ96DT6 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG4CQ96DT6 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG4CQ96DT6 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG4CQ96DT6 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms