Protein–RNA interactions for Protein: Q96CC6

RHBDF1, Inactive rhomboid protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDF1Q96CC6 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHBDF1Q96CC6 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHBDF1Q96CC6 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHBDF1Q96CC6 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHBDF1Q96CC6 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHBDF1Q96CC6 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHBDF1Q96CC6 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHBDF1Q96CC6 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHBDF1Q96CC6 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHBDF1Q96CC6 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHBDF1Q96CC6 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHBDF1Q96CC6 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHBDF1Q96CC6 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RHBDF1Q96CC6 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RHBDF1Q96CC6 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHBDF1Q96CC6 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHBDF1Q96CC6 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHBDF1Q96CC6 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RHBDF1Q96CC6 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHBDF1Q96CC6 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHBDF1Q96CC6 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHBDF1Q96CC6 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHBDF1Q96CC6 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHBDF1Q96CC6 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHBDF1Q96CC6 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHBDF1Q96CC6 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHBDF1Q96CC6 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHBDF1Q96CC6 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHBDF1Q96CC6 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHBDF1Q96CC6 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHBDF1Q96CC6 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHBDF1Q96CC6 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHBDF1Q96CC6 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHBDF1Q96CC6 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHBDF1Q96CC6 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHBDF1Q96CC6 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHBDF1Q96CC6 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHBDF1Q96CC6 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHBDF1Q96CC6 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHBDF1Q96CC6 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHBDF1Q96CC6 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHBDF1Q96CC6 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHBDF1Q96CC6 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHBDF1Q96CC6 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHBDF1Q96CC6 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHBDF1Q96CC6 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHBDF1Q96CC6 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHBDF1Q96CC6 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHBDF1Q96CC6 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHBDF1Q96CC6 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHBDF1Q96CC6 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHBDF1Q96CC6 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RHBDF1Q96CC6 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RHBDF1Q96CC6 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHBDF1Q96CC6 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHBDF1Q96CC6 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHBDF1Q96CC6 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHBDF1Q96CC6 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHBDF1Q96CC6 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHBDF1Q96CC6 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHBDF1Q96CC6 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHBDF1Q96CC6 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHBDF1Q96CC6 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHBDF1Q96CC6 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHBDF1Q96CC6 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHBDF1Q96CC6 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHBDF1Q96CC6 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHBDF1Q96CC6 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHBDF1Q96CC6 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHBDF1Q96CC6 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHBDF1Q96CC6 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHBDF1Q96CC6 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHBDF1Q96CC6 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHBDF1Q96CC6 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHBDF1Q96CC6 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHBDF1Q96CC6 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHBDF1Q96CC6 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHBDF1Q96CC6 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHBDF1Q96CC6 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHBDF1Q96CC6 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHBDF1Q96CC6 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHBDF1Q96CC6 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHBDF1Q96CC6 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHBDF1Q96CC6 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHBDF1Q96CC6 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHBDF1Q96CC6 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHBDF1Q96CC6 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHBDF1Q96CC6 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHBDF1Q96CC6 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHBDF1Q96CC6 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHBDF1Q96CC6 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHBDF1Q96CC6 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHBDF1Q96CC6 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHBDF1Q96CC6 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHBDF1Q96CC6 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHBDF1Q96CC6 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHBDF1Q96CC6 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHBDF1Q96CC6 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHBDF1Q96CC6 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHBDF1Q96CC6 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms