Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
PRG4Q92954 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRG4Q92954 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRG4Q92954 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRG4Q92954 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRG4Q92954 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRG4Q92954 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRG4Q92954 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRG4Q92954 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRG4Q92954 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRG4Q92954 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRG4Q92954 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRG4Q92954 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRG4Q92954 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRG4Q92954 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRG4Q92954 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
PRG4Q92954 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRG4Q92954 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRG4Q92954 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
PRG4Q92954 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRG4Q92954 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRG4Q92954 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRG4Q92954 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRG4Q92954 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRG4Q92954 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRG4Q92954 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRG4Q92954 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRG4Q92954 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRG4Q92954 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRG4Q92954 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRG4Q92954 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRG4Q92954 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRG4Q92954 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRG4Q92954 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRG4Q92954 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRG4Q92954 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRG4Q92954 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRG4Q92954 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRG4Q92954 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
PRG4Q92954 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRG4Q92954 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRG4Q92954 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRG4Q92954 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRG4Q92954 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRG4Q92954 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRG4Q92954 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRG4Q92954 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
PRG4Q92954 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRG4Q92954 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRG4Q92954 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRG4Q92954 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRG4Q92954 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRG4Q92954 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRG4Q92954 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRG4Q92954 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRG4Q92954 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PRG4Q92954 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PRG4Q92954 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PRG4Q92954 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PRG4Q92954 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PRG4Q92954 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PRG4Q92954 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PRG4Q92954 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
PRG4Q92954 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
PRG4Q92954 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PRG4Q92954 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PRG4Q92954 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PRG4Q92954 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PRG4Q92954 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PRG4Q92954 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PRG4Q92954 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PRG4Q92954 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PRG4Q92954 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PRG4Q92954 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRG4Q92954 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRG4Q92954 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRG4Q92954 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRG4Q92954 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRG4Q92954 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRG4Q92954 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
PRG4Q92954 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRG4Q92954 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRG4Q92954 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRG4Q92954 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
PRG4Q92954 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRG4Q92954 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRG4Q92954 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRG4Q92954 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
PRG4Q92954 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
PRG4Q92954 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRG4Q92954 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRG4Q92954 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRG4Q92954 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRG4Q92954 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRG4Q92954 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRG4Q92954 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRG4Q92954 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
PRG4Q92954 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRG4Q92954 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRG4Q92954 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms