Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHF3Q92576 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms