Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH9

ATL2, Atlastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL2Q8NHH9 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms