Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG4DQ86TL0 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms