Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z398

ZNF550, Zinc finger protein 550, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF550Q7Z398 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF550Q7Z398 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms