Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTF1AQ7RTS3 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTF1AQ7RTS3 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PTF1AQ7RTS3 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTF1AQ7RTS3 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTF1AQ7RTS3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTF1AQ7RTS3 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTF1AQ7RTS3 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTF1AQ7RTS3 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PTF1AQ7RTS3 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTF1AQ7RTS3 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PTF1AQ7RTS3 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTF1AQ7RTS3 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTF1AQ7RTS3 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PTF1AQ7RTS3 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTF1AQ7RTS3 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PTF1AQ7RTS3 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTF1AQ7RTS3 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTF1AQ7RTS3 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTF1AQ7RTS3 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTF1AQ7RTS3 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTF1AQ7RTS3 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTF1AQ7RTS3 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTF1AQ7RTS3 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTF1AQ7RTS3 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTF1AQ7RTS3 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTF1AQ7RTS3 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTF1AQ7RTS3 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTF1AQ7RTS3 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTF1AQ7RTS3 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTF1AQ7RTS3 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PTF1AQ7RTS3 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTF1AQ7RTS3 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTF1AQ7RTS3 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTF1AQ7RTS3 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTF1AQ7RTS3 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PTF1AQ7RTS3 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTF1AQ7RTS3 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTF1AQ7RTS3 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTF1AQ7RTS3 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTF1AQ7RTS3 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PTF1AQ7RTS3 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PTF1AQ7RTS3 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTF1AQ7RTS3 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTF1AQ7RTS3 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTF1AQ7RTS3 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTF1AQ7RTS3 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTF1AQ7RTS3 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTF1AQ7RTS3 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTF1AQ7RTS3 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTF1AQ7RTS3 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTF1AQ7RTS3 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTF1AQ7RTS3 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTF1AQ7RTS3 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTF1AQ7RTS3 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTF1AQ7RTS3 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTF1AQ7RTS3 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTF1AQ7RTS3 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PTF1AQ7RTS3 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTF1AQ7RTS3 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PTF1AQ7RTS3 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTF1AQ7RTS3 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTF1AQ7RTS3 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTF1AQ7RTS3 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PTF1AQ7RTS3 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTF1AQ7RTS3 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTF1AQ7RTS3 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTF1AQ7RTS3 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTF1AQ7RTS3 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTF1AQ7RTS3 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTF1AQ7RTS3 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTF1AQ7RTS3 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTF1AQ7RTS3 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTF1AQ7RTS3 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTF1AQ7RTS3 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTF1AQ7RTS3 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTF1AQ7RTS3 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTF1AQ7RTS3 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTF1AQ7RTS3 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTF1AQ7RTS3 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTF1AQ7RTS3 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTF1AQ7RTS3 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTF1AQ7RTS3 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTF1AQ7RTS3 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTF1AQ7RTS3 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTF1AQ7RTS3 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTF1AQ7RTS3 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTF1AQ7RTS3 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTF1AQ7RTS3 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTF1AQ7RTS3 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTF1AQ7RTS3 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTF1AQ7RTS3 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTF1AQ7RTS3 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTF1AQ7RTS3 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTF1AQ7RTS3 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTF1AQ7RTS3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTF1AQ7RTS3 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTF1AQ7RTS3 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTF1AQ7RTS3 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTF1AQ7RTS3 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.7 ms