Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HECW1Q76N89 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HECW1Q76N89 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HECW1Q76N89 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HECW1Q76N89 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HECW1Q76N89 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HECW1Q76N89 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HECW1Q76N89 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HECW1Q76N89 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HECW1Q76N89 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HECW1Q76N89 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
HECW1Q76N89 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.92
HECW1Q76N89 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HECW1Q76N89 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HECW1Q76N89 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HECW1Q76N89 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HECW1Q76N89 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HECW1Q76N89 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HECW1Q76N89 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HECW1Q76N89 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HECW1Q76N89 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HECW1Q76N89 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HECW1Q76N89 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HECW1Q76N89 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
HECW1Q76N89 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HECW1Q76N89 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HECW1Q76N89 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HECW1Q76N89 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HECW1Q76N89 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HECW1Q76N89 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HECW1Q76N89 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HECW1Q76N89 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HECW1Q76N89 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HECW1Q76N89 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HECW1Q76N89 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
HECW1Q76N89 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HECW1Q76N89 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HECW1Q76N89 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HECW1Q76N89 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HECW1Q76N89 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HECW1Q76N89 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HECW1Q76N89 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
HECW1Q76N89 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HECW1Q76N89 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HECW1Q76N89 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HECW1Q76N89 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HECW1Q76N89 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HECW1Q76N89 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HECW1Q76N89 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HECW1Q76N89 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HECW1Q76N89 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HECW1Q76N89 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HECW1Q76N89 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HECW1Q76N89 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HECW1Q76N89 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HECW1Q76N89 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HECW1Q76N89 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HECW1Q76N89 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HECW1Q76N89 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HECW1Q76N89 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HECW1Q76N89 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HECW1Q76N89 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HECW1Q76N89 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HECW1Q76N89 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HECW1Q76N89 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HECW1Q76N89 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HECW1Q76N89 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HECW1Q76N89 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HECW1Q76N89 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HECW1Q76N89 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HECW1Q76N89 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HECW1Q76N89 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HECW1Q76N89 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HECW1Q76N89 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HECW1Q76N89 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HECW1Q76N89 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HECW1Q76N89 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HECW1Q76N89 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HECW1Q76N89 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HECW1Q76N89 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HECW1Q76N89 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HECW1Q76N89 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HECW1Q76N89 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HECW1Q76N89 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HECW1Q76N89 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HECW1Q76N89 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
HECW1Q76N89 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HECW1Q76N89 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HECW1Q76N89 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
HECW1Q76N89 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
HECW1Q76N89 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HECW1Q76N89 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HECW1Q76N89 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HECW1Q76N89 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HECW1Q76N89 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HECW1Q76N89 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HECW1Q76N89 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HECW1Q76N89 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HECW1Q76N89 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HECW1Q76N89 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms