Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR7

LRRC9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC9Q6ZRR7 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
LRRC9Q6ZRR7 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
LRRC9Q6ZRR7 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
LRRC9Q6ZRR7 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
LRRC9Q6ZRR7 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
LRRC9Q6ZRR7 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
LRRC9Q6ZRR7 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
LRRC9Q6ZRR7 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
LRRC9Q6ZRR7 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
LRRC9Q6ZRR7 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
LRRC9Q6ZRR7 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
LRRC9Q6ZRR7 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
LRRC9Q6ZRR7 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRRC9Q6ZRR7 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRRC9Q6ZRR7 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRRC9Q6ZRR7 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRRC9Q6ZRR7 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
LRRC9Q6ZRR7 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRRC9Q6ZRR7 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
LRRC9Q6ZRR7 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRRC9Q6ZRR7 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRRC9Q6ZRR7 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRRC9Q6ZRR7 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRRC9Q6ZRR7 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRRC9Q6ZRR7 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
LRRC9Q6ZRR7 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRRC9Q6ZRR7 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRRC9Q6ZRR7 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRRC9Q6ZRR7 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRRC9Q6ZRR7 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRRC9Q6ZRR7 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRRC9Q6ZRR7 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRRC9Q6ZRR7 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRRC9Q6ZRR7 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRRC9Q6ZRR7 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRRC9Q6ZRR7 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRRC9Q6ZRR7 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRRC9Q6ZRR7 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRRC9Q6ZRR7 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRRC9Q6ZRR7 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRRC9Q6ZRR7 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRRC9Q6ZRR7 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
LRRC9Q6ZRR7 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRRC9Q6ZRR7 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRRC9Q6ZRR7 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRRC9Q6ZRR7 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRRC9Q6ZRR7 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRRC9Q6ZRR7 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
LRRC9Q6ZRR7 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRRC9Q6ZRR7 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
LRRC9Q6ZRR7 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
LRRC9Q6ZRR7 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRRC9Q6ZRR7 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRRC9Q6ZRR7 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRRC9Q6ZRR7 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
LRRC9Q6ZRR7 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRRC9Q6ZRR7 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRRC9Q6ZRR7 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRRC9Q6ZRR7 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRRC9Q6ZRR7 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRRC9Q6ZRR7 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRRC9Q6ZRR7 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRRC9Q6ZRR7 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRRC9Q6ZRR7 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRRC9Q6ZRR7 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRRC9Q6ZRR7 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
LRRC9Q6ZRR7 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
LRRC9Q6ZRR7 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRRC9Q6ZRR7 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRRC9Q6ZRR7 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
LRRC9Q6ZRR7 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
LRRC9Q6ZRR7 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRRC9Q6ZRR7 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRC9Q6ZRR7 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRC9Q6ZRR7 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRC9Q6ZRR7 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRC9Q6ZRR7 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRC9Q6ZRR7 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRC9Q6ZRR7 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRC9Q6ZRR7 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRC9Q6ZRR7 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRC9Q6ZRR7 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRC9Q6ZRR7 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRC9Q6ZRR7 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRC9Q6ZRR7 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRC9Q6ZRR7 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
LRRC9Q6ZRR7 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRRC9Q6ZRR7 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRRC9Q6ZRR7 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRRC9Q6ZRR7 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRRC9Q6ZRR7 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRRC9Q6ZRR7 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRRC9Q6ZRR7 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRRC9Q6ZRR7 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRRC9Q6ZRR7 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRRC9Q6ZRR7 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRRC9Q6ZRR7 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRRC9Q6ZRR7 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRRC9Q6ZRR7 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRRC9Q6ZRR7 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms