Protein–RNA interactions for Protein: Q5VV17

OTUD1, OTU domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD1Q5VV17 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
OTUD1Q5VV17 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
OTUD1Q5VV17 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
OTUD1Q5VV17 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
OTUD1Q5VV17 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
OTUD1Q5VV17 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
OTUD1Q5VV17 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
OTUD1Q5VV17 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
OTUD1Q5VV17 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
OTUD1Q5VV17 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
OTUD1Q5VV17 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
OTUD1Q5VV17 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
OTUD1Q5VV17 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
OTUD1Q5VV17 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
OTUD1Q5VV17 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
OTUD1Q5VV17 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
OTUD1Q5VV17 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
OTUD1Q5VV17 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
OTUD1Q5VV17 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
OTUD1Q5VV17 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
OTUD1Q5VV17 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
OTUD1Q5VV17 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
OTUD1Q5VV17 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
OTUD1Q5VV17 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
OTUD1Q5VV17 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
OTUD1Q5VV17 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
OTUD1Q5VV17 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
OTUD1Q5VV17 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
OTUD1Q5VV17 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
OTUD1Q5VV17 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
OTUD1Q5VV17 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
OTUD1Q5VV17 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
OTUD1Q5VV17 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
OTUD1Q5VV17 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
OTUD1Q5VV17 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
OTUD1Q5VV17 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
OTUD1Q5VV17 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
OTUD1Q5VV17 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
OTUD1Q5VV17 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
OTUD1Q5VV17 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
OTUD1Q5VV17 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
OTUD1Q5VV17 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
OTUD1Q5VV17 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
OTUD1Q5VV17 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
OTUD1Q5VV17 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
OTUD1Q5VV17 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
OTUD1Q5VV17 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
OTUD1Q5VV17 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
OTUD1Q5VV17 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
OTUD1Q5VV17 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
OTUD1Q5VV17 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
OTUD1Q5VV17 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
OTUD1Q5VV17 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
OTUD1Q5VV17 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
OTUD1Q5VV17 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
OTUD1Q5VV17 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
OTUD1Q5VV17 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
OTUD1Q5VV17 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
OTUD1Q5VV17 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
OTUD1Q5VV17 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
OTUD1Q5VV17 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
OTUD1Q5VV17 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
OTUD1Q5VV17 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
OTUD1Q5VV17 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
OTUD1Q5VV17 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
OTUD1Q5VV17 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
OTUD1Q5VV17 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
OTUD1Q5VV17 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
OTUD1Q5VV17 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
OTUD1Q5VV17 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
OTUD1Q5VV17 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
OTUD1Q5VV17 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
OTUD1Q5VV17 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
OTUD1Q5VV17 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
OTUD1Q5VV17 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
OTUD1Q5VV17 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
OTUD1Q5VV17 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
OTUD1Q5VV17 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
OTUD1Q5VV17 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
OTUD1Q5VV17 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
OTUD1Q5VV17 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
OTUD1Q5VV17 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
OTUD1Q5VV17 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
OTUD1Q5VV17 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
OTUD1Q5VV17 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
OTUD1Q5VV17 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
OTUD1Q5VV17 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
OTUD1Q5VV17 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
OTUD1Q5VV17 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
OTUD1Q5VV17 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
OTUD1Q5VV17 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
OTUD1Q5VV17 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
OTUD1Q5VV17 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
OTUD1Q5VV17 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
OTUD1Q5VV17 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
OTUD1Q5VV17 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
OTUD1Q5VV17 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
OTUD1Q5VV17 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
OTUD1Q5VV17 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
OTUD1Q5VV17 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.3 ms