Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE5

NUP188, Nucleoporin NUP188 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP188Q5SRE5 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NUP188Q5SRE5 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUP188Q5SRE5 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUP188Q5SRE5 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUP188Q5SRE5 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NUP188Q5SRE5 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NUP188Q5SRE5 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NUP188Q5SRE5 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NUP188Q5SRE5 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUP188Q5SRE5 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUP188Q5SRE5 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUP188Q5SRE5 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NUP188Q5SRE5 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUP188Q5SRE5 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUP188Q5SRE5 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUP188Q5SRE5 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NUP188Q5SRE5 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUP188Q5SRE5 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUP188Q5SRE5 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUP188Q5SRE5 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUP188Q5SRE5 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUP188Q5SRE5 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUP188Q5SRE5 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUP188Q5SRE5 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUP188Q5SRE5 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUP188Q5SRE5 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUP188Q5SRE5 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUP188Q5SRE5 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUP188Q5SRE5 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUP188Q5SRE5 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUP188Q5SRE5 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUP188Q5SRE5 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NUP188Q5SRE5 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUP188Q5SRE5 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUP188Q5SRE5 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUP188Q5SRE5 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUP188Q5SRE5 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NUP188Q5SRE5 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUP188Q5SRE5 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUP188Q5SRE5 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUP188Q5SRE5 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUP188Q5SRE5 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUP188Q5SRE5 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUP188Q5SRE5 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUP188Q5SRE5 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUP188Q5SRE5 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUP188Q5SRE5 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NUP188Q5SRE5 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUP188Q5SRE5 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUP188Q5SRE5 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUP188Q5SRE5 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUP188Q5SRE5 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUP188Q5SRE5 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUP188Q5SRE5 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUP188Q5SRE5 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUP188Q5SRE5 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUP188Q5SRE5 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUP188Q5SRE5 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUP188Q5SRE5 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUP188Q5SRE5 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUP188Q5SRE5 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUP188Q5SRE5 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUP188Q5SRE5 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUP188Q5SRE5 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUP188Q5SRE5 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUP188Q5SRE5 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUP188Q5SRE5 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUP188Q5SRE5 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUP188Q5SRE5 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUP188Q5SRE5 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUP188Q5SRE5 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUP188Q5SRE5 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUP188Q5SRE5 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUP188Q5SRE5 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUP188Q5SRE5 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUP188Q5SRE5 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUP188Q5SRE5 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NUP188Q5SRE5 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUP188Q5SRE5 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NUP188Q5SRE5 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUP188Q5SRE5 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUP188Q5SRE5 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUP188Q5SRE5 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUP188Q5SRE5 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NUP188Q5SRE5 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUP188Q5SRE5 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NUP188Q5SRE5 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUP188Q5SRE5 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUP188Q5SRE5 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUP188Q5SRE5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUP188Q5SRE5 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUP188Q5SRE5 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUP188Q5SRE5 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUP188Q5SRE5 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUP188Q5SRE5 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUP188Q5SRE5 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUP188Q5SRE5 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NUP188Q5SRE5 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NUP188Q5SRE5 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUP188Q5SRE5 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms