Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC27A3Q5K4L6 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC27A3Q5K4L6 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC27A3Q5K4L6 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC27A3Q5K4L6 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC27A3Q5K4L6 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC27A3Q5K4L6 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC27A3Q5K4L6 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC27A3Q5K4L6 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC27A3Q5K4L6 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC27A3Q5K4L6 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC27A3Q5K4L6 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC27A3Q5K4L6 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC27A3Q5K4L6 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC27A3Q5K4L6 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC27A3Q5K4L6 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC27A3Q5K4L6 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC27A3Q5K4L6 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC27A3Q5K4L6 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC27A3Q5K4L6 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC27A3Q5K4L6 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC27A3Q5K4L6 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC27A3Q5K4L6 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC27A3Q5K4L6 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC27A3Q5K4L6 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC27A3Q5K4L6 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC27A3Q5K4L6 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC27A3Q5K4L6 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC27A3Q5K4L6 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC27A3Q5K4L6 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC27A3Q5K4L6 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC27A3Q5K4L6 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC27A3Q5K4L6 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC27A3Q5K4L6 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC27A3Q5K4L6 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC27A3Q5K4L6 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC27A3Q5K4L6 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC27A3Q5K4L6 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC27A3Q5K4L6 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC27A3Q5K4L6 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC27A3Q5K4L6 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC27A3Q5K4L6 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC27A3Q5K4L6 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC27A3Q5K4L6 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC27A3Q5K4L6 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC27A3Q5K4L6 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC27A3Q5K4L6 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC27A3Q5K4L6 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC27A3Q5K4L6 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC27A3Q5K4L6 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC27A3Q5K4L6 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC27A3Q5K4L6 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC27A3Q5K4L6 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC27A3Q5K4L6 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC27A3Q5K4L6 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC27A3Q5K4L6 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC27A3Q5K4L6 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC27A3Q5K4L6 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC27A3Q5K4L6 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC27A3Q5K4L6 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC27A3Q5K4L6 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC27A3Q5K4L6 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC27A3Q5K4L6 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC27A3Q5K4L6 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC27A3Q5K4L6 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC27A3Q5K4L6 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC27A3Q5K4L6 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC27A3Q5K4L6 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC27A3Q5K4L6 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC27A3Q5K4L6 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC27A3Q5K4L6 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC27A3Q5K4L6 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC27A3Q5K4L6 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC27A3Q5K4L6 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC27A3Q5K4L6 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC27A3Q5K4L6 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC27A3Q5K4L6 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC27A3Q5K4L6 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC27A3Q5K4L6 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC27A3Q5K4L6 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC27A3Q5K4L6 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC27A3Q5K4L6 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC27A3Q5K4L6 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC27A3Q5K4L6 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC27A3Q5K4L6 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC27A3Q5K4L6 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC27A3Q5K4L6 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC27A3Q5K4L6 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC27A3Q5K4L6 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC27A3Q5K4L6 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC27A3Q5K4L6 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC27A3Q5K4L6 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC27A3Q5K4L6 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC27A3Q5K4L6 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC27A3Q5K4L6 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC27A3Q5K4L6 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC27A3Q5K4L6 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC27A3Q5K4L6 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC27A3Q5K4L6 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC27A3Q5K4L6 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms