Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms