Protein–RNA interactions for Protein: Q3YBR2

TBRG1, Transforming growth factor beta regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBRG1Q3YBR2 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TBRG1Q3YBR2 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms